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宿主細胞殘留 DNA 樣本前處理試劑盒(磁珠法)實驗操作細則
發表時間:2022-10-26
宿主細胞殘留 DNA 樣本前處理試劑盒(磁珠法)實驗操作細則:
一、 樣本處理:
1. 取 100ul 待檢樣本至 1.5ml 干凈的離心管中,加入 10ul 5M NaCl 溶液,用渦旋 振 蕩器充分震蕩 10 秒;
2. 加入 10ul 蛋白酶 K,在渦旋振蕩器上充分震蕩 10 秒;
3. 配制新鮮的裂解液,其組成為: 130ul 裂解液/100ul 樣本, 9ul 肝糖原/100 樣本, 0.2ul tRNA/100ul 樣本,充分混勻以制成新鮮配制的裂解液;
4. 將 139ul 新鮮配制的裂解液加入到樣本管中, 然后用渦旋振蕩器充分震蕩 10 秒, 取出短 暫快速離心 5 秒,然后放置在 56oC 孵育 30 分鐘;
二、 DNA 捕獲:
1. 將磁珠充分渦旋振蕩以完全重懸;
2. 將樣本管從孵育器中取出, 進行簡短的離心,將液體收集到管底,然后加入完全重懸的 磁珠 60ul 和 230ul 結合液,在渦旋振蕩器上充分震蕩 10 秒; (注意: 在加入磁珠時, 需經 常振蕩重懸磁珠, 以保證吸取時磁珠的均勻性。建議每加 3-4 組樣本后, 重懸磁珠后再進行 后續樣本的添加)
3. 將震蕩后的樣本管,置于旋轉混勻器或渦旋振蕩器上 10 分鐘以進行磁珠捕獲;
4. 將樣本管從旋轉混勻器上取下,在 10000g 的條件下離心 1 分鐘使磁珠充分聚集;
5. 將離心后的樣本管置于磁力架上, 待溶液完全澄清后, 用槍頭小心移去上清(注: 避免 槍頭攪動磁珠,使得磁珠同上清一起被除去從而影響得率);
三、 洗滌:
1. 樣本管移去上清后,不必將樣本管從磁力架上取下,直接加入 400ul 洗滌液;
2. 待溶液完全澄清后,磁珠完全分離,用槍頭小心移去上清;
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3. 保持樣本管在磁力架上, 加入 400ul 洗滌液, 待溶液澄清, 磁珠完全分離后, 用槍頭小 心移去上清;
4. 將樣本管從磁力架上取下, 于 10000g 的條件下離心 30 秒,使得殘留的洗滌液完全聚集 到管底;
5. 將樣本管置于磁力架上,待磁珠完全分離后,用 10ul 槍頭小心移除殘留的液體;
6. 將樣本管從磁力架上取下,置于 70oC 金屬浴中,放置 4 分鐘, 除去殘留的乙醇(注: 若干燥不夠, 殘留的乙醇會影響后續的定量檢測反應);待磁珠團出現裂紋時,將樣本管從 金屬浴中取出進行 DNA 洗脫;
四、 DNA 洗脫:
1. 沿著樣本管的管壁加入 50- 100ul 洗脫液,用 100ul 的槍頭反復吹吸,以完全重懸磁珠;
2. 將樣本管置于 70oC 孵育器孵育 10 分鐘;
3. 將樣本管從孵育器中取出,于 20000g 離心 2 分鐘,然后至于磁力架上,待磁珠完全分 離后,用 10ul 槍頭小心將上清液體轉移至新的干凈的離心管中;
4. 為了避免吸入磁珠,在離心管中還剩余少量液體時,將其于 20000g 離心 2 分鐘,然后 至于磁力架上以吸出剩余的液體。
一、 樣本處理:
1. 取 100ul 待檢樣本至 1.5ml 干凈的離心管中,加入 10ul 5M NaCl 溶液,用渦旋 振 蕩器充分震蕩 10 秒;
2. 加入 10ul 蛋白酶 K,在渦旋振蕩器上充分震蕩 10 秒;
3. 配制新鮮的裂解液,其組成為: 130ul 裂解液/100ul 樣本, 9ul 肝糖原/100 樣本, 0.2ul tRNA/100ul 樣本,充分混勻以制成新鮮配制的裂解液;
4. 將 139ul 新鮮配制的裂解液加入到樣本管中, 然后用渦旋振蕩器充分震蕩 10 秒, 取出短 暫快速離心 5 秒,然后放置在 56oC 孵育 30 分鐘;
二、 DNA 捕獲:
1. 將磁珠充分渦旋振蕩以完全重懸;
2. 將樣本管從孵育器中取出, 進行簡短的離心,將液體收集到管底,然后加入完全重懸的 磁珠 60ul 和 230ul 結合液,在渦旋振蕩器上充分震蕩 10 秒; (注意: 在加入磁珠時, 需經 常振蕩重懸磁珠, 以保證吸取時磁珠的均勻性。建議每加 3-4 組樣本后, 重懸磁珠后再進行 后續樣本的添加)
3. 將震蕩后的樣本管,置于旋轉混勻器或渦旋振蕩器上 10 分鐘以進行磁珠捕獲;
4. 將樣本管從旋轉混勻器上取下,在 10000g 的條件下離心 1 分鐘使磁珠充分聚集;
5. 將離心后的樣本管置于磁力架上, 待溶液完全澄清后, 用槍頭小心移去上清(注: 避免 槍頭攪動磁珠,使得磁珠同上清一起被除去從而影響得率);
三、 洗滌:
1. 樣本管移去上清后,不必將樣本管從磁力架上取下,直接加入 400ul 洗滌液;
2. 待溶液完全澄清后,磁珠完全分離,用槍頭小心移去上清;
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3. 保持樣本管在磁力架上, 加入 400ul 洗滌液, 待溶液澄清, 磁珠完全分離后, 用槍頭小 心移去上清;
4. 將樣本管從磁力架上取下, 于 10000g 的條件下離心 30 秒,使得殘留的洗滌液完全聚集 到管底;
5. 將樣本管置于磁力架上,待磁珠完全分離后,用 10ul 槍頭小心移除殘留的液體;
6. 將樣本管從磁力架上取下,置于 70oC 金屬浴中,放置 4 分鐘, 除去殘留的乙醇(注: 若干燥不夠, 殘留的乙醇會影響后續的定量檢測反應);待磁珠團出現裂紋時,將樣本管從 金屬浴中取出進行 DNA 洗脫;
四、 DNA 洗脫:
1. 沿著樣本管的管壁加入 50- 100ul 洗脫液,用 100ul 的槍頭反復吹吸,以完全重懸磁珠;
2. 將樣本管置于 70oC 孵育器孵育 10 分鐘;
3. 將樣本管從孵育器中取出,于 20000g 離心 2 分鐘,然后至于磁力架上,待磁珠完全分 離后,用 10ul 槍頭小心將上清液體轉移至新的干凈的離心管中;
4. 為了避免吸入磁珠,在離心管中還剩余少量液體時,將其于 20000g 離心 2 分鐘,然后 至于磁力架上以吸出剩余的液體。